電子信息管理系統應用于政府管理工作中，面臨的最大問題之一也是首要問題就是信息安全問題，它決定了政府工作能否正常展開，是否能夠順利執行政府權力等。因此，政府電子信息系統建設的順利進行不僅要有技術上的保障，而且還要有一系列與之相配套的法律法規。例如1999年美國政府出臺電子簽名法律和政府文書工作減少法律，在2001年又出臺電子政府法律，所以從我國目前來看電子信息系統安全問題方面的認識和采取的行為措施還比較薄弱，只是推行了簡單的政策法規來規范政府電子信息系統的管理，而在當今安全意識提升的現實狀況下，對信息安全、電子口令保護和支付的相關法律還不夠完善，相對欠缺。