西安交通大學葉凱教授團隊在腫瘤內部空間異質性研究方面取得重要進展，其成果為腫瘤研究開辟了全新路徑，為腫瘤精準治療提供了重要依據。相關研究成果以《STMiner：以基因為中心的空間轉錄組學解析腫瘤組織》為題，于2月12日發表在《細胞·基因組學》雜志上。

腫瘤組織具有高度異質性，細胞類型多樣、基因表達雜亂無章，區域界限模糊。傳統空間轉錄組技術難以全面揭示腫瘤的特性。傳統方法通常將采樣點視為獨立的“房子”，統計每個點的細胞類型和基因表達信息，容易產生誤差。

為解決這一難題，葉凱教授團隊提出以基因表達的空間分布來構建整體計算框架的方法，在研究中成功定位了高度復雜、邊界不清的腫瘤組織中的獨特基因表達模式，清晰區分了正常與異常組織的邊界，并識別出一些采用傳統空間轉錄組技術時被忽視的關鍵基因和空間結構。

葉凱教授團隊長期致力于生物信息學方法研究，并將開發的方法運用于遺傳病和腫瘤的早診和精準治療。

“由于腫瘤組織的高異質性和空間轉錄組數據的高稀疏性，傳統側重局部臨近特征的策略往往在腫瘤空間轉錄組數據分析中出現遺漏和偏差?！比~凱表示，以基因為中心的空間轉錄組學解析腫瘤組織方法，將離散的采樣點轉化為連續的基因分布地圖，就像利用零散的“房屋信息”繪制出一張完整的“居民分布圖”。這種“全景地圖”不僅能更準確地反映腫瘤組織的真實情況，還能減少干擾信息，幫助醫療團隊“按圖索驥”，制定針對性的精準治療方案，促進腫瘤早診和精準治療。